ส่วนการผ่าฟันคุดจะใช้ในกรณีที่ฟันคุดไม่สามารถขึ้นมาในช่องปากได้ ทันตแพทย์จะใช้เครื่องมือผ่าตัดเปิดเหงือก กรอกระดูกหรือแบ่งฟันเป็นชิ้นเล็กๆ เพื่อนำฟันคุดออก และโดยทั่วไปแล้วการผ่าฟันคุดจะต้องมีการเย็บแผลผ่าฟันคุด หรือการถอนฟันคุดเจ็บไหม ผ่าฟันคุด หรือการถอนฟันคุดกี่วันหายมีฟันคุดไม่เอ